但由于受到氣候環境的影響和安裝條件的限制，太陽能熱水器有其自身不可改變的局限性。相比之下，空氣能熱泵熱水器彌補了太陽能熱水器的不足，更加充分地利用了太陽能光熱這一優秀能源。從實際應用方面來說，空氣能熱泵熱水器確實優勝于太陽能熱水器，其節能省錢、安裝、使用方便的特點。
工作原理對比：太陽能熱水器主要是真空管，和板式 通過涂層吸收太陽光線加熱液體，達到必然溫度滿足許多人洗浴要求的，而空氣能熱水器是通過壓縮機做功把空大氣的壓力縮，從而把能量轉移到水中，然后加熱水的，需要通電才能正常工作。對水壓力來說，太陽能一般是無壓的，空氣能都是承壓的。
安裝環境對比：太陽能熱水器直接受光照影響，沒有太陽照射的天氣只能依靠電輔加熱；一次性儲水不夠用時，也只能依靠電輔加熱。以同等用水量全年耗電量做對比，耗電量高于空氣能熱水器。就安裝條件而言，傳統屋頂整體式太陽熱水器的安裝與城市建筑風格不協調，而且樓頂空間與承重能力有限，尤其是目前高層建筑逐漸增多，太陽能熱水器的局限性顯得更加明顯。空氣能熱水器安裝不受位置限制，可以根據自己需要靈活進行設計。
功能壽命對比：太陽能熱水器，主要是洗澡用的，空氣能熱水器屬于中央熱水，洗衣，做飯，洗菜，家里一切用到熱水之處都可以用，不受天氣影響全天候供應熱水；太陽能冬天陰雨天需要電輔助。空氣能熱水器一年的使用費用要比太陽能省1/2，空氣能熱水器的使用壽命也比較長，一般能用10年左右。
